З благословення митрополита Амвросія і ігумені Нектарії у вересні 2008 року продзвенів перший дзвінок в недільній школі Свято-Успенського Єлецького жіночого монастиря.

У 2009 році, після канонізації святителя Філарета (Гумілевського), школа була названа ім’ям святого.

З благословення настоятельки монастиря в 2008-2009 навчальному році роботу школи очолювала черниця Амвросія (Гуцол). З 2009 по 2012 рік директором школи був А.Ю. Челишев. З вересня 2012 року директором і духівником школи є протоієрей В’ячеслав Селюченко.

Основними завданнями недільної школи є релігійно-моральне навчання і виховання багатогранної особистості християнина; адаптація до життя в сучасному суспільстві відповідно до норм християнської моралі; формування загальної культури.

На заняттях учні знайомляться з історією Церкви, головними християнськими святами і пов’язаними з ними євангельськими подіями та житіями святих; вивчають церковно-слов’янська мова, основи хорового і церковного співу, історію Чернігівського краю.

Учні школи беруть активну участь у різних єпархіальних заходах – православних виставках і фестивалях, конкурсах, змаганнях, концертах. Діти разом з вчителями і батьками ставлять спектаклі, шиють костюми і роблять декорації. Oсобое місце в житті школи відводиться паломницьким поїздкам, походам та екскурсіях.

У школі також проводяться заняття для дорослих:

– З вивчення Святого Письма (протоієрей Георгій Лобанов);

– По православної психології (протоієрей Віктор Вус).